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迈入研究生阶段,我们面临的任务除了搞好研究以外,还有学术论文的发表。笔者读研究生的时候,在发表论文方面曾经多次碰壁,如今算是熬过来了,在论文写作方面积累了一些经验和教训,在此和大家分享一下,希望多多少少会对你有所帮助。
首先,多读文献是关键。可以说,每一篇医学研究论文多多少少都会引用前人的工作,所以提升阅读文献的能力也是一大项,是一个科学研究工作者的基本素质。如今随着信息化,互联网,多种传媒的推陈出新,信息量的高度膨胀甚至泛滥日益成为大家的共识,各种参差不齐的期刊更是如雨后春笋般涌出,面对这种情形,如何提高阅读文献习惯以最少时间获取最多最有益的信息就成为决定科研进度的一个重要因素。我个人体会是在阅读前一定要有明确的目的,把握好泛读和精读的关系和平衡。现代生物医学学科交叉趋盛,新技术日新月异,只盯着狭小的领域肯定是不行的,这就需要泛读较大领域视野内的文献,把握当前的研究趋势和热点,比如我坚持看最新的science、nature、cell泛读即可,有兴趣的看看摘要再有兴趣就看全文。
套用我国的一句老话:熟读唐诗三百首,不会作诗也会吟。硕士期间读了不下大几百篇文献,其中1,2百高水平的文章主要是CNS上的要精读,记下读书笔记。文章的研究思路,研究路线,技术方法,结果分析,一一解析,最后总结文章的创新点,为何能发,从中那些可以值得学习借鉴。并要求自己用1,2句话并尽可能用一个model图概括该文特色,也就是takehomemessage.记到本子上,下次看是一目了然,提纲挈领,便于记忆。事实上,自今年2010年起,Cell开始要求每篇发表的论文作者提供一个graphicalabstract,勾勒出该文的要点,以便读者一目了然领会文章的贡献和意义,也正是出于此意。 对于刚刚进实验室的我们来说,检索和阅读文献是首先必须要认真做好的,这是整个研究生学习阶段最重要的一步。老师在实验室所推行的weeklyreport是非常好的培养方法,如果每一位新进实验室的研究生在整个学习阶段都能够这样执行,收获将是非常大的。下面是一些具体的做法。
1、中文文献:刚进实验室的时候,很多人都会感到很茫然,内心里有很多想法,浑身也后使不出的劲,到处都是看不完的文献,但就是不知道从哪里下手。个人感觉首先阅读CNKI和万方数据库的优秀硕硕士论文对于寻找课题和开拓思路很重要。首先选好你所感兴趣的方向,下载大约10篇左右的论文,好好的读一下。等这些论文读完了,基本上对该方向的实验方法,实验思路和相关的英文单词都有了一定的了解。如果有武大的同学的话,可以上武大的数据库,相对华工的来说,它的比较全,且新一些。对于我们实验室发表的一些文章,尽量的读一些,读的懂更好,读不懂也没有关系,但需要对我们实验室有一些了解。 2、英文文献:主要就是Pubmed。基本的方法就是在其检索栏中输入关键词,可以找到你所需要的大部分文献,通过学校图书馆可以下载绝大部分全文。如果不行的话可以通过以下方法获取:
①Pubmed里面有个Linkout选项,当其首选数据库不能够查到全文的话,可通过Linkout链接到其他的数据库查找;
②向国外通讯作者索取,有时候给别人发了email,别人不理你,不要怕,继续发,或者换个邮箱发,我们常用的163或sina有时候国外就收不到。不管别人给不给你全文都会给你答复的,越牛的人越会给你回复。
③上DXY检索区求助,基本上是有求必应,特别是你的积分大于20分的时候。所以需要自己在DXY上回答别人的问题以获得积分,给别人帮助,收获的是自己。 当你在Pubmed上查文献的时候,有很多重要的信息需要注意:
①在Pubmed的Abstract状态下,右边是其链接全文的网址,下面是与这篇文献相关的文章,这些文章很重要,需要仔细看看。 ②进入全文网站之后,在全文的右侧有这篇文章被引用的次数,在文章的最后有引用改文章的文献列表,这些非常重要。
③关于引用文献可以查Scopus数据库,很全很新的。查找这些引用文献,可以找到很多与你所查文章相似的文献,有时候的收获比直接在Pubmed里面查还要多得多。3、文献整理和归纳:有时候明明查到多该文献,但过一段时间就是找不到,关键的原因是我们对文献的整理和归纳不够。个人感觉一下几点需要注意: ①文章的名称一定要写明,有时候直接下的时候它都是数字或字母表示,一定要当时就更改过来,有时候文章名很长,就需要我们给其简化命名;
②用关键词建立文件夹,并标明日期(如CR-20080705);
③如果对文献管理软件如endnote或referencesmanager熟悉的话,用这两个软件管文献会非常方便,但个人感觉并不推荐这种用法,因为我们用的都是D版软件,万一那天被限制使用了就完蛋了;
④经常整理,将相关的文献合并,改删的就删。还有一点个人体会,就是在精读感兴趣的论文时一定要把握好度,认识到任何研究都是有局限性的,尤其是如今竞争相当激烈,大家赶着发文章的压力很大,不是全部但是至少我认为不少研究是有些水分的(这点从现在经常发生撤稿的事件可见一斑),这点对中国学者本人系就职十年的资深论文编辑,工作中与各大期刊杂志社进行学术交流过程中建立了稳定的编辑朋友圈,系多家杂志社的特约编辑,常年供稿负责研究生毕业论文等叩1760405151尤其重要,因为我们从小的教育就是以灌输为主缺乏些质疑精神。科学研究就是质疑的game,认识到这点我们在阅读时就容易去伪存真,吸取精华,而不是盲从,从而避免自己在试验设计和实施时走进死胡同。 掌握了基本的检索方法,并且阅读了一些相关的文献之后,就需要对自己的课题做一些基本的规划。
1、课题设计:总的原则是在老板课题的范围之内选题,同时提出自己新的想法。老板的课题都是大的方向,有时候是非常好的idea,但具体的实施过程也需要我们去创新,要把握基本原则,但又不拘于表面形式,这样才能把我们的想法和老板的课题完整结合起来。个人感觉研究生开题报告是一个非常重要的培养过程,写一份开题报告非常能够锻炼能力和思维。其内容可以与老板的课题相结合,但最好是提出自己的新思路。同时如果每年每位研究生都能够写一份国家自然科学基金或省自然科学基金的标书,这种锻炼对研究生尤其重要,同时也可以给老板提供一些好的idea。
2、实验手段:了解实验室常用的方法技术(从理论原理到基本的操作),精通一种实验技术(能够解决该门技术中大部分的问题)。比如我们实验室大部分人都会膜片钳,但我个人感觉精通的人并不多。实验技术只是手段,实验的思路才是最重要,同时必须掌握一门核心技术,这样就可以和人合作,与人交换。在实验上能够赢得合作者的尊重同时能够保证实验又快又顺的进行。为了掌握实验技术,对于刚进实验室的师弟师妹们来说很关键的一点就是要学会打杂,要舍得吃苦,不要怕吃亏。你给师兄师姐们做了很多无私的贡献的同时,你也学到了实验技术,同时还建立了良好的个人关系,这些非常重要。今天的付出,也许很多年后才有回报,但没有付出就永远不会有回报。吃苦耐劳,与人为善在任何时候都是适用的。 研究生论文写好后,就要选刊了,看自己的研究结果意义和本领域哪些杂志所发文章处于类似的水准。如果经常看文章,这点不难,没事就浏览一下本领域的每个杂志的要目tableofcontents,感兴趣的title就点击看看摘要,大概就对自己的文章水平略知一二了。自己做的硕士课题做出了一个比较有意义的新发现,觉得投NatureCellBiology(18分),GenesDevelopment(15分)一档的杂志比较有戏,自己很快根据NCB要求并精读两篇NCB范文写了初稿,给导师修稿后就投到NCB。得到评审意见是要补充新数据,我们补充了一些,但是有些数据无法很快补充,针对所研究蛋白的抗体很不容易制备,我们在response信进行了辩解,二稿投出后莫名其妙被编辑直接拒绝了,并没有送一审专家们再审。在投GD之前,我们决定冲冲Science(尽管不报太大希望),同时尝试一些新试验以替代必须要有抗体才能进行的试验。可喜的是一审通过(Science一审会直接淘汰大约75%稿件不送出审稿),送出二审。
一个多月得到意见,要求对我们提出的model给出更多证据支持,这个任务在目前的实验室条件下很难达到,而且我也想早点毕业。所以就放弃了。就投了保底的杂志GD,同时继续补些可以manage的试验。一个月得到意见,acceptdependentonrevision,只有3个月期限。好在要求补充的一些试验就是我们预计到的正在补的,补充的试验虽然有挑战性,经过艰苦摸索(实验室条件不是太好,不是大牛实验室),进展顺利,这也是我迄今做试验的巅峰时刻,做出结果的瞬间,我真是有阿基米德在洗澡时发现浮力原理高兴得来不及穿上裤子跑到街上大喊Eureka(我找到了)的感觉,因为自己全身心的投入和巧妙的设计构思终于得到回报。3个月后投二稿,就接受了。整个投稿过程期刊之家网是优秀学术期刊杂志投稿发表论文指南性权威网站,倾力打造的学术期刊信息查询系统包括北大中文核心期刊,科技统计源核心等优秀学术期刊杂志,学科覆盖了教育医学等各个行业,为优秀学术期刊推荐对口学术论文,提高论文发表命中率回头来看,受益匪浅。其实如果我们先就补了一些数据,
也许NCB也会接受,不过GD公认是发育生物学领域的No.1,所以也不足为惜。这篇文章发表一年多已经被引用10多次,还被UniversityofNorthCarolinaatChapelHill的研究生课程DevelopmentalGenetics列为选读文献,所以还不错。还有就是对评审人的意见,一般来说都是比较负责的,可以说没有评审意见,文章质量不会上到一个高度,自己看自己评,总是有局限性,所谓当局者迷,旁观者清。就是这个道理。Peerreview系统饱受争议这么多年,还是在采用说明其存在的合理性。
人总是有点惰性,发文章这件事会push自己去写,改,构思和做试验,通过发GD文章的过程我的能力提高不少,GD文章我和导师共享通讯作者。毕业后我觉得自己有能力完全独立投稿,所以就想以自己硕士论文前言部分为基础,加上评论最新发的一些本领域的好文章(包括自己的GD文章),写篇综述反映本领域的进展。自己不是大牛,导师也帮不上忙,不可能得到编辑邀请在一流杂志写,所以我就自己查,找到CellularandMolecularLifeSciences这个杂志比较对口,IF也不错有5分多(自己虽然不完全认同IF,但是大家都以此为参照,所以在选刊时也得考虑)。在投稿时自己有信心觉得能上,因为看了一些该杂志最近发的文章知道水平和我的差不多,果然接到审稿意见基本接受,要求修稿,这是第一次独立修稿和写response信,也顺利完成,文章得以发表。
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